Hola Daniel.
Personalmente no uso import cost porque le agrega mucho peso a mi workflow, probablemente si no funciona es por el mismo detalle de que se vuelve muy pesado ejecutar muchos plugins.
Con respecto a Prettier, hay que indicarle en la configuración que también auto-ordene con archivos de javascript. La configuración que tengo es la siguiente:
“[javascript]”:{ “editor.formatOnSave”: true}
En teoría, con lo anterior debería funcionar. Si no, no dudes en contactarme a ernesto@blockchainacademy.mx. Gustoso de ayudar.